XD2000に関する質問

新年度の利用申請がまだ行われていない場合、年度が改まった段階で共同利用計算機上のデータへはアクセスできなくなります。
但し、利用申請が間に合わなくても各共同利用計算機のhomeディレクトリと付随するwork領域 、およびファイルサーバのデータが直ちに消去されることはありません。
具体的な期間につきましては、共同利用計算機におけるホームディレクトリの保持期間についてのページを参照してください。
ファイルサーバについては、ファイルサーバのページを参照してください。
(最終更新日 2026年4月13日)

srunを実行する際に，bashを起動して，ulimit -c 0を実行したうえで，プログラムを実行してください。

具体的には，ジョブスクリプトにおいて，次のようにプログラムを実行する場合，

srun ./a.out

次のように変更してください。

srun bash -c 'ulimit -c 0; exec ./a.out'

Linux の通常のシグナルである SIGUSR1/SIGUSR2（ユーザ定義シグナル）を Slurm 経由でジョブスクリプトに送信し、受信時に任意の処理を行うことができます。
しかし、シグナルが届いた時点でジョブが実行中だと、trap で定義した処理が実行されないままタイムアウトとなり、ジョブ自体が終了してしまうことがあります。その結果、シグナル受信時に実行したかった処理を行えない場合があります。

以下のように./a.outをバックグランドで実行するとシグナルを受けることができます。

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=usr
#SBATCH --partition=M-debug
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=64
#SBATCH --mem=16GB
#SBATCH --time=00:15:00
#SBATCH --signal=B:USR1@30

trap 'echo "$(date) got USR1" >> "$SLURM_SUBMIT_DIR/signal.log"' USR1

srun ./a.out &
SRUN_PID=$!
wait $SRUN_PID

Yes, you can.
The general rule for resubmission is as follows.

• Before the submission deadline, applicants may submit their application multiple times.
• If multiple submissions are made by the same applicant,
  • only the most recent application will be forwarded to the review committee, and
  • all other submissions will be automatically discarded. No action is required by the applicant.
• Once the submission deadline has passed, resubmission of applications will not be permitted.

This rule applies not only to applications for XD2000 but also to those for the GPU cluster and PCC, although no submission deadline is set for the latter two categories.

こちらのページをご覧ください。
(最終更新日 2025年5月1日)

入力したパスワードがこのページにある三つの「自然科学研究機構の情報セキュリティ対策基準」を満たしているかどうかをご確認ください。
また、以下のコマンドで条件を満たすパスワードが生成可能です。

mkpasswd -l 12

(最終更新日 2025年5月2日)

XD2000では apptainer が利用可能です。
そしてXD2000ではインターネット接続が可能です。
よって apptainer に各種ソフトウェアをインストールし、御自分で環境構築をお願いいたします。
Apptainerの使い方についてはこちらのページもしくはこちらのマニュアルをご覧ください。
(最終更新日 2025年5月1日)

このページにまとまっています。ご覧ください。
(最終更新日 2025年4月30日)