qdelを用いてジョブ削除しようとしましたが、消えません。

どのようにすれば良いでしょうか?

計算ノードとの通信状況が悪い時にこれが発生することがあります。
qdel コマンドにオプション -W force を付けて実行してみてください。

  qdel -W force ジョブID ...

オプション -W force の意味は "Deletes the job whether or not the job' execution host is reachable." です。
詳しくは man qdel を参照してください。
なお上記のオプションを付けてもジョブを qdel できない場合にはジョブに何らかの障害が発生している可能性があります。
その場合はこのページから報告をお願いします。
(最終更新日 2024年以前)