/mwork{1,2} は以前あった作業領域に比べてだいぶ速いようです。何が違うのですか?

その通りです。
特に小さなファイルを多数書き込む場合、/mwork{1,2} への書き込み速度は以前にあった作業領域へのそれよりずっと高いです。
これは /mwork{1,2} がFreeBSDのZFSファイルシステムにssdによるキャッシュ機能を与えたものだからです。
とりわけ小さなファイルを多く書き込む利用者は、その高い速度を体感するでしょう。
(最終更新日 2024年以前)