私のコードをオプション -shared-intel -mcmodel=medium を付けてコンパイルし、qsubを使って投入しました。
しかし、以下のエラーが出て終わります。
./a.out: error while loading shared libraries: libifport.so.5: cannot open shared object file: No such file or directory
他のコードでは以下のエラーとなりました。
./a.out: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory
qsub 経由ではなく m000 のコマンドライン上で直接実行すると、これらは正常に動きます。
何がおかしいのでしょうか？
利用者向け手引のPBS関係の記載の下部の「qsubスクリプト内でのモジュールのロード」にもありますが、PBSジョブの実行に必要なモジュールをqsubスクリプト内でも読み込んでおく必要があります。
もしqsubスクリプトがsh対応なら、実行させたいコードの前に以下を置いてください。
source /usr/share/Modules/init/sh module load intel/2024
もしqsubスクリプトがcshやtcsh対応なら、sourceするファイルを変更します。
source /usr/share/Modules/init/csh module load intel/2024
もしくは
source /usr/share/Modules/init/tcsh module load intel/2024
などです。
Intel環境以外のモジュールを読み込む際も上記と同様な記載を行います。
例えばPBSジョブ内でPython環境を同時に利用したいならば、以下のようです。
source /usr/share/Modules/init/sh module load anaconda intel/2024
必要な条件に応じて適切なモジュールを読み込んでください。
(最終更新日 2025年6月3日)